Kampus The Stony Brook School se rozkládá na 55 akrech a zahrnuje 43 budov. Nachází se přibližně 60 mil od New York City, přičemž vlakové spojení je přímo u areálu. V docházkové vzdálenosti jsou restaurace, obchody, pláže i přístavy, a mezinárodní letiště JFK a LGA jsou dostupná zhruba za hodinu. Studenti mají k dispozici moderní sportovní zázemí – dvě hřiště s umělým povrchem, šest tenisových kurtů, baseballové hřiště, běžeckou dráhu, posilovnu, basketbalové kurty či zápasnickou místnost.
Silnou stránkou kampusu je také akademické vybavení: STEM laboratoř pro robotiku, raketové modelářství a programování, specializované laboratoře biologie, chemie, fyziky a environmentálních věd, stejně jako knihovna a řada učeben. Pro setkávání studentů slouží také jídelna, studentské centrum a vlastní kaple, které podporují život celé komunity.