Kampus The Stony Brook School sa rozkladá na 55 akroch a zahŕňa 43 budov. Nachádza sa približne 60 míľ od New York City, pričom vlakové spojenie je priamo pri areáli. V pešej vzdialenosti sú reštaurácie, obchody, pláže aj prístavy a medzinárodné letiská JFK a LGA sú dostupné približne za hodinu. Študenti majú k dispozícii moderné športové zázemie – dve ihriská s umelým povrchom, šesť tenisových kurtov, baseballové ihrisko, bežeckú dráhu, posilňovňu, basketbalové kurty či zápasnícku miestnosť.
Silnou stránkou kampusu je aj akademické vybavenie: STEM laboratórium pre robotiku, raketové modelárstvo a programovanie, špecializované laboratóriá biológie, chémie, fyziky a environmentálnych vied, ako aj knižnica a množstvo učební. Na stretávanie študentov slúži aj jedáleň, študentské centrum a vlastná kaplnka, ktoré podporujú život celej komunity.